La Junta de Directores es la autoridad máxima dentro de la estructura organizacional de la Institución. Es el cuerpo responsable de la calidad y planificación académica, de la integridad y salud fiscal de la Institución, así como del cumplimiento de la misión, visión y objetivos de la misma. Además, tiene la responsabilidad de establecer las políticas que rigen la operación de la Institución.

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Está compuesta por ocho miembros en representación de diversos sectores de la comunidad.